Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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