Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tubb6Q922F4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms