Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Klc3Q91W40 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Klc3Q91W40 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms