Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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