Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgip1Q8VD37 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms