Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
RfxapQ8VCG9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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