Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Dnajc28Q8VCE1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Dnajc28Q8VCE1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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