Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GcaQ8VC88 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
GcaQ8VC88 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms