Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Casc3Q8K3W3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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