Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MyripQ8K3I4 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MyripQ8K3I4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MyripQ8K3I4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MyripQ8K3I4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MyripQ8K3I4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms