Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ssh3Q8K330 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ssh3Q8K330 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Ssh3Q8K330 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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