Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pacs1Q8K212 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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