Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FgbQ8K0E8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FgbQ8K0E8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FgbQ8K0E8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms