Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkn3Q8K045 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkn3Q8K045 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms