Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trip10Q8CJ53 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms