Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LgsnQ8CIX8 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms