Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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SbsnQ8CIT9 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms