Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CopaQ8CIE6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms