Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Cdkl1Q8CEQ0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms