Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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Gm9955Q8CEJ8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
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