Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc38Q8CDN8 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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