Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Lrif1Q8CDD9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Lrif1Q8CDD9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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