Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Samd4aQ8CBY1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Samd4aQ8CBY1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms