Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ephb1Q8CBF3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ephb1Q8CBF3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms