Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Aph1bQ8C7N7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms