Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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