Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek11Q8C0Q4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek11Q8C0Q4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms