Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Snx16Q8C080 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Snx16Q8C080 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms