Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rbbp5Q8BX09 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbbp5Q8BX09 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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