Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ctdsp2Q8BX07 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ctdsp2Q8BX07 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms