Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Pggt1bQ8BUY9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pggt1bQ8BUY9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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