Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH75

Rnf41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf41Q8BH75 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf41Q8BH75 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rnf41Q8BH75 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rnf41Q8BH75 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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