Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms