Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSP5

Vtcn1, V-set domain containing T-cell activation inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vtcn1Q7TSP5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vtcn1Q7TSP5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vtcn1Q7TSP5 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms