Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 9630028H03Rik-202ENSMUST00000153402 1559 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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ClmQ7TSN2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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