Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Actn1Q7TPR4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms