Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nphp3Q7TNH6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp3Q7TNH6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms