Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rph3alQ768S4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rph3alQ768S4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms