Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Topbp1Q6ZQF0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms