Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ssx9Q6XAS3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ssx9Q6XAS3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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