Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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