Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp49Q6P9L4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Usp49Q6P9L4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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