Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Smchd1Q6P5D8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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