Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rrp12Q6P5B0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rrp12Q6P5B0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms