Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NipblQ6KCD5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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