Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tpm4Q6IRU2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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