Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarca2Q6DIC0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms