Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms