Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rftn1Q6A0D4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms