Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
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Jmjd1cQ69ZK6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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